La carrera de Ingeniería Civil en Biotecnología de la Universidad de La Frontera (UFRO) organizó un microcurso sobre acoplamiento molecular, herramienta computacional que permite simular interacciones entre moléculas y que tiene aplicaciones en áreas como la biomedicina y la farmacología.
El acoplamiento molecular (docking molecular) es una herramienta computacional de creciente aplicación en las ciencias químicas, biológicas y biomédicas. Para acercar esta técnica a estudiantes de pre y postgrado y fortalecer sus competencias para la investigación, la carrera de Ingeniería Civil en Biotecnología de la Universidad de La Frontera, bajo la dirección del Dr. Mauricio Zamorano Mosnaim, planificó y organizó el microcurso “MolNexus”.
Esta actividad formativa fue dirigida por el Dr. Jorge Félix Beltrán Lissabet, profesor asociado del Departamento de Ingeniería Química, quien abordó los fundamentos y aplicaciones del acoplamiento molecular, técnica que permite simular cómo interactúan y se unen un receptor y un ligando.
“Esta es una técnica muy utilizada tanto en las ciencias químicas como en las ciencias biológicas. Tiene múltiples aplicaciones, desde las ciencias biomédicas hasta la farmacología, particularmente en la búsqueda y desarrollo de potenciales fármacos”, explicó el investigador, agregando que este tema se vincula directamente con el trabajo de investigación que actualmente desarrolla en el marco de un proyecto Fondecyt de Iniciación enfocado en el estudio de péptidos artificiales contra Piscirickettsia salmonis, bacteria que afecta a los salmónidos y que genera importantes pérdidas para la industria acuícola.
“En este contexto, estas técnicas permiten estudiar moléculas que todavía no han sido exploradas y evaluar su potencial antes de llevarlas al laboratorio. Esto permite realizar una primera selección mediante simulaciones computacionales y, posteriormente, concentrar los esfuerzos experimentales en aquellos candidatos que presentan mayor potencial”, señaló el Dr. Beltrán, destacando que las aplicaciones de esta herramienta también trascienden el ámbito farmacológico.
“El acoplamiento molecular puede contribuir a la identificación de potenciales fármacos para enfermedades como el cáncer, pero también al desarrollo de compuestos para otras áreas de las ciencias biológicas o incluso productos para la agroindustria. Una de sus principales ventajas es que permite optimizar recursos y tiempo en las primeras etapas de investigación”, precisó en sus palabras.
Tecnología desarrollada desde la bioinformática
Durante el microcurso, las y los participantes conocieron AutoDock Vina, uno de los programas utilizados para realizar acoplamiento molecular. Sin embargo, su utilización puede resultar compleja para quienes no cuentan con formación en programación, debido a que requiere trabajar mediante líneas de comandos.
Frente a esta dificultad, el Dr. Beltrán desarrolló su propio software, dotado de una interfaz más sencilla e intuitiva, con el propósito de facilitar el acceso a esta herramienta a investigadores de distintas disciplinas.
“Mi formación en ciencias biológicas y mi interés por la programación me permitieron combinar ambos mundos y desarrollar una herramienta que facilite el acceso a este tipo de técnicas, independiente de si el investigador tiene o no conocimientos de programación”, explicó este académico que es licenciado en Microbiología por la Universidad de La Habana, Cuba y que, posteriormente, continuó su formación en Chile, cursando el Doctorado en Ciencias, mención Biología Celular y Molecular Aplicada de la UFRO.
